ওয়াই-টাইপ আণবিক চালকদের হীরার মতো একটি ঘনিষ্ঠ-প্যাকযুক্ত ষড়্ভুজ কাঠামো রয়েছে। যদি বিটা খাঁচাটি হীরার কার্বন অ্যাটম নোডগুলি প্রতিস্থাপনের জন্য স্ট্রাকচারাল ইউনিট হিসাবে ব্যবহৃত হয়, এবং দুটি সংলগ্ন বিটা খাঁচা ষড়ভুজ কলামার খাঁচাগুলির সাথে সংযুক্ত থাকে, অর্থাৎ পাঁচটি বিটা খাঁচা চারটি ষড়ভুজ কলামার খাঁচাগুলির সাথে একত্রে সংযুক্ত থাকে, যার মধ্যে একটি বিটা বেটাথের মধ্যে অবস্থিত এবং চারটি বেটার খাঁচাগুলি অবস্থিত এবং বাকী চারটি বেটাডের মধ্যে অবস্থিত এবং বাকী চারটি বেটাডের মধ্যে রয়েছে। স্ফটিক কাঠামো গঠিত হয়। এই কাঠামোর সাথে লিঙ্ক চালিয়ে যাওয়ার মাধ্যমে, ওয়াই-টাইপ আণবিক চালনী কাঠামো প্রাপ্ত হয়। এই কাঠামোয়, β খাঁচা এবং ষড়ভুজ কলামার খাঁচা দ্বারা গঠিত বৃহত খাঁচা একটি আট-পার্শ্বযুক্ত জিওলাইট খাঁচা, এবং তাদের আন্তঃসংযোগযুক্ত উইন্ডো গর্তগুলি বারোটি বাইনারি রিং, যার গড় কার্যকর ছিদ্রের আকার 0.74nm, যা ওয়াই-টাইপ অণু চালকের ছিদ্র আকার। এক্স টাইপের আণবিক চালনী এবং ওয়াই টাইপের আণবিক চালনী কাঠামো হুবহু একই, তবে ওয়াই টাইপের আণবিক চালনী সিলিকা অ্যালুমিনিয়াম অনুপাত বেশি, হাইড্রোথার্মাল স্থিতিশীলতা শক্তিশালী, সুতরাং এটি আরও ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়।
